В аварийной комиссии Роскосмоса наиболее вероятной причиной назвали «вскрытие бака «О» третьей ступени ракеты-носителя в результате воздействия элементов, возникших при разрушении двигателя 11Д55 вследствие возгорания и дальнейшего разрушения насоса окислителя. Причиной возгорания насоса окислителя могло стать возможное попадание посторонних частиц в полость насоса либо возможное нарушение технологии сборки двигателя. Дефект, имеющий производственный характер, проявился в полёте».
Напомним, ракета-носитель «Союз-У» собирается на самарском РКЦ «Прогресс», на первые две ступени устанавливаются двигатели НК производства самарского завода «Кузнецов». Двигатель 11Д55, ставящийся на третью ступень, выпускает Воронежский механический завод.